STPI dalam mencapai tujuannya, menjalin kerjasama dengan pihak - pihak lain dalam bidang penerbangan:
- Piper Aircraft Inc. (Authorized Service Center)
- Cessna Aircraft Company (Authorized Service Center)
- ASNZ New Zealand. (Penerbang dan Type Rating A320)
- ÈCOLE NATIONALE DE L’AVIATION CIVILE / ENAC Perancis. (Pendidikan Program Magister dan Pelatihan Bidang Penerbangan Berskala Internasional sesuai Standar dan Rekomendasi International Civil Aviation Organization (ICAO)
- ADHORIA LTD. Thailand. (Penggunaan Simulator B737 & A320)
- Air Asia Indonesia (Diklat Teknik Pesawat Udara dan Simulator A320)
- Sriwijaya Air (Simulator B737 dan A320, Diklat Teknik Pesawat Udara)
- GMF Aero Asia (Diklat Teknik Pesawat udara)
- PT. Dirgantara Indonesia (Diklat Teknik Pesawat Udara)
- AirNav Indonesia (Diklat Navigasi Penerbangan)
- PT. Nusa Halmahera Minerals (Diklat Manajemen Bandar Udara dan PKPPK)
- PT. Angkasa Pura I (Diklat Perawatan Kendaraan PKPPK)
- PT. Angkasa Pura II (Diklat AMC)
- PT. Badak Natural Gas Liquefaction (Diklat Manajemen Bandar Udara)
- PT. Carpediem Mandiri (Diklat Penerbang Helicopter)
- PT. LEN (Kerjasama dalam Perawatan Pesawat Latih dan Sewa Hanggar)
- Pemda Maluku Utara (Diklat Pembentukan)
- Pemda Merauke (Diklat Pembentukan)